Inhabers können ihr Girokonto unabhängig von Öffnungszeiten und Ort der Bank oder Sparkasse per Online-Banking im Internet verwalten. So werden Transaktionen durch einen Webbrowser durchgeführt. Die Aktivierung eines Online-Banking Kontos erfolgt, nachdem der Inhaber eine Einverständniserklärung bei der Bank oder Sparkasse unterschrieben hat. Bei manchen Anbietern wird dem Inhaber eines Girokontos eine Start-PIN zugestellt, um das Online-Banking optimal abzusichern. Nach Eingabe der Start-PIN können Inhaber ihre PIN meistens selbst bestimmen, um den Missbrauch durch Unbefugte komplett auszuschließen. Inhaber eines Girokontos, die Online-Banking nutzen, haben also eine PIN-Nummer für ihre Kundenkarte und eine zweite für die Nutzung des Online-Bankings. Online-Banking ist für Inhaber eines Girokontos besonders attraktiv, da man den Kontostand und die letzten Buchungen schnell und unkompliziert kontrollieren kann. Außerdem kann man Transaktionen durchführen, wozu man die TAN benötigt. Diese ersetzt die normalerweise erforderliche Unterschrift des Kunden und gilt nur für eine Transaktionsnummer. Daher sendet die Bank oder Sparkasse dem Inhaber des Girokontos eine ganze TAN-Liste zu. Des Weiteren wird die Online-Verwaltung des Girokontos durch moderne Verschlüsselungssysteme wie dem HBCI (Homebanking Computer Interface) verschlüsselt und somit für den Inhaber eines Girokontos gesichert. Die Absicherung durch HBCI erfolgt mittels einer geheimcodegesicherten Chipkarte, die ebenfalls vom Anbieter des Girokontos ausgestellt wird. Zusätzlich wird ein Kartenlesegerät benötigt. Inhaber eines Girokontos können ein Überweisungslimit festlegen, wodurch eine zusätzliche Absicherung des Online-Bankings besteht. Niemals sollten Nutzer des Online-Bankings ihre PIN-Nummer weitergeben, auch nicht, wenn sie per Email dazu aufgefordert werden. Banken und Sparkassen fordern Inhaber nie zur öffentlichen Eingabe ihrer PIN-Nummer auf, sodass es sich bei solchen Aufforderungen um einen sogenannten „Phishing-Angriff“ handelt. Über Sicherheitszertifikate im Webbrowser können Inhaber erkennen, ob es sich tatsächlich um den Internetauftritt des Anbieters oder um eine Fälschung handelt. Welche Banken oder Sparkassen Online-Banking für Inhaber eines Girokontos anbieten, kann man bei einem kostenlosen Vergleich im Internet erfahren.